Seinen ersten Auftritt im Anime hat Raikou in der Episode Ausgebüxt!. Dort sehen Togepi und ein Hundemon, wie es nach einem Gewitter verschwindet.
In Zoroark: Meister der Illusionen
In Zoroark: Meister der Illusionen ist Raikou sowohl mit Entei als auch mit Suicune in Coronia City anwesend, um die Stadt vor Zoroark zu schützen. Die drei gelten als Wächter der Stadt, weshalb sie nach den Schein-Angriffen von Zoroark dieses angreifen, da sie denken, es würde die Stadt zerstören. Wie sich herausstellt, handelt es sich bei den Zerstörungen allerdings nur um Illusionen.
Ken Kodai will mithilfe von Zoroark alle Menschen aus der Stadt ausschließen, um ungehindert nach den von Celebi hervorgerufenen Zeitwellen suchen zu können. Doch Zoroark kann die Raubkatzen überzeugen, dass es gezwungenermaßen für Kodai die Stadt mit Illusionen überdeckt, damit Zorua nichts geschieht. Letztendlich gelingt es den Raubkatzen Kodai zu stoppen, bevor er die Zeitwellen erreicht, um ein erneutes Sterben aller Pflanzen in der Stadt zu verhindern.
Seinen bisher wichtigsten Auftritt hat es in dem SpecialDie Legende des Donners. Die Team Rocket-OffiziereAttila und Hun versuchen dort mit dem Crystal-System, der von Professor Sebastian entwickelt wurde, Raikou zu fangen. Der Kristall zieht Elektrizität an, absorbiert sie und gibt sie verstärkt an seinen Ausgangspunkt wieder ab. Ihr Plan wird jedoch von Kenta, Marina, Jackson und Eusin verhindert, wodurch Raikou weiterhin in Freiheit bleibt.
In Pokémon – Der Film: Du bist dran! tritt es ebenfalls auf, als das dritte Mitglied des Bestien-Trios, dem die Freunde begegnen. Es tritt unvermittelt auf und ist nach einem Blitzschlag schon wieder verschwunden.
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