Die Drachenhöhle ist eine Höhle nördlich der Arena von Ebenholz City und mit der Route 45 der einzige Ort in Gold, Silber und Pokémon Kristall, an dem man wilde Dratini fangen kann.
Nach dem Sieg über Sandra möchte sie einem den Orden nicht geben. Sie will erst, dass man ihr das Item Drachenzahn aus der Höhle bringt. In Kristall und Pokémon HeartGold und SoulSilver muss man aber stattdessen eine Prüfung bestehen, die aus Fragen über das Verhältnis zwischen Trainer und Pokémon bestehen. Sie werden in der Höhle von einem alten Mann gestellt. Danach erhält man von Sandra den Drachenorden. Falls man noch einen Platz im Team hat, erhält man auch ein Dratini mit Turbotempo vom alten Herrn. Pokémon kann man nur finden, indem man surft. Jeden Dienstag und Donnerstag trifft man hier den Rivalen. Es kommt aber zu keinem Kampf.
Nachdem man ihn am Mondberg in Kanto besiegt hat, trifft man hier in HeartGold und SoulSilver erneut auf den Rivalen. Er ist zum Trainieren in die Drachenhöhle gekommen, sieht jedoch die Lehren der Weisen als unnütz an. Kurz darauf treffen auch Siegfried und Sandra ein und fordern den Spieler und seinen Rivalen zu einem Multikampf heraus.
In Porentief rein sieht man erstmals die Drachenhöhle, dort ist jedoch nur von einem Tunnelsystem die Rede, dass ins Heilige Land der Drachen führt. Dort befinden sich der Drachenschrein und der Drachenzahn.
In Iris VS Ibuki! Dragon Master e no Michi!! bringen Sandra und LiliaKaumalat zum Heiligen Land, damit es dort leben kann und die Stadt nicht mehr verwüstet, wozu sie die Höhle durchqueren. Man sieht nur deren Ausgang. Kurz darauf verlässt dieses die Gegend jedoch, da es sich Lilia anschließen will.
Im Manga
Sandra betritt die Drachenhöhle in VS. Dragonir und erwähnt dabei, wie sie als Hort vieler Drachen-Pokémon perfekt für ihr Training ist. Kurz darauf erscheinen auch eine Menge Garados und Dragoran, die jedoch nicht kampfesbereit sind, wie es normalerweise der Fall ist. Sandra erkennt in der Mitte des Sees der Höhle daraufhin Suicune, der Grund, warum die Pokémon sich zurückhalten. Wütend, dass ein fremdes Pokémon die Höhle betreten hat, bekämpft Sandra das Legendäre mit ihrem Dragonir. Nach einigen Angriffen glaubt Sandra zuerst, das Wilde besiegt zu haben, erkennt aber, dass sie bloß eine Illusion attackierte. Letztlich greift Suicune sie mit Blubbstrahl an und besiegt sie und ihr Pokémon. Nachdem Suicune daraufhin wieder verschwunden ist, erscheint der Meister des Drachenclans, der Sandra erklärt, dass Suicune einen würdigen Trainer gesucht hat.
Wie man in einem Rückblick von Lilia in VS. Sharfax erfährt, ist Ebenholz City die Heimatstadt des Mädchens. So trainierte sie in ihrer Kindheit auch oft mit den Drachen aus der Drachenhöhle.