Schatten-Dialga
Das Schatten-Dialga ist der Endgegner in Pokémon Mystery Dungeon 2. Da der Zeitturm (dank Darkrai) anfing ein zustürzen, hat Dialga Reptain zufolge immer mehr und mehr "seinen Verstand verloren", wodurch es zu einer sehr primitiven Version Dialgas, zu Schatten-Dialga wurde. Es interessiert sich nur für die eigene Selbsterhaltung. Deshalb hat es Zwirrfinst aufgetragen, Reptain daran zu hindern in der Vergangenheit die Zahnräder der Zeit zum Zeitturm zu bringen, da dadurch der Lauf der Geschichte geändert und Schatten-Dialga ausgelöscht worden wäre. Sobald es besiegt ist, wird es zu einem "normalen" Dialga. Es ist unmöglich, es zu rekrutieren, man kann nur dem normalen Dialga begegnen und es rekrutieren, indem man wieder (nach dem Ending der Story) mit Lapras zum Verborgenen Land reist und es bis zum Zeitturm schafft. Man kann es mit dem Crypto-Lugia aus Pokémon XD vergleichen.
Attacken
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Geschichte
Das erste Mal sieht man Schatten-Dialga in einer Sequenz, bei der Zwirrfinst mit ihm redet. Später trifft man dann auch auf es, wobei es dort auf einer Klippe steht, Zeitenlärm einsetzt und damit Celebi erschwert die kurze Zeitreise zum Portal welches in die Vergangenheit führt zu machen. Hat man dann am Ende des Spiels Zwirrfinst erledigt und den Zeitturm gemeistert, hält es den Protagonisten und den Partner davon ab, die Zahnräder einzusetzen, und wird so zum finalen Boss, den man vor dem Ending besiegen muss. Allerdings handelt es sich eigentlich nur bei dem Dialga aus der Zukunft um Schatten-Dialga, da die "Verwandlung" und die Machtübernahme der Dunkelheit bei dem Vergangenheits-Dialga laut dem Protagonisten und seinem Partner noch nicht ganz abgeschlossen ist (Erkennbar unter anderem auch daran, dass Dialga vor dem Endgegnerkampf noch spricht, Schatten-Dialga aber nur brüllt). Außerdem ist Schattendialga aus der Zukunft viel dunkler als das aus der Gegenwart. Es beherrscht die Selben Attacken wie das "normale" Dialga.
Nach dem Verschwinden des Protagonisten
Nachdem der Protagonist wieder zum Mensch und Schatten-Dialga wieder normal geworden ist, geht alles wieder fast seinen gewohnten Gang. Allerdings ist das Partnerpokemon nach einigen Monaten immer noch traurig über das Verschwinden der Hauptperson. Dialga bemerkt das und hat Mitleid mit dem Pokémon. Daher schickt er den Protagonisten, als Dank für das Aufhalten des Zusammenbrechens des Zeitturms, wieder in die Welt der Pokémon zurück, in dem es die Zeitlinie verändert. Darkrai nutzt dies aus, um den Protagonisten zu beschuldigen, eine Raum- Zeitannomalie auszulösen, was zwar stimmt, aber sie ist so gering, dass kein Schaden entsteht, während Darkrai seine Macht über die Traumdimension nutzt, um Chaos zu erzeugen.