Das Partner-Pokémon (aus Pokémon Ranger) ist ständig an der Seite des Protagonisten.
Im ersten Teil der Reihe ist es nur möglich zwischen zwei Partnern und auch nur durch die Wahl des Geschlechts zu entscheiden. Ist er männlich, so ist sein Partner ein 
Minun, ist der Spieler weiblich, so ist es ein 
Plusle. Beide diese Pokémon beherrschen die Poké-Stärke Entladung.
In Pokémon Ranger 2 kann man folgende Starter bekommen, unabhängig davon, ob man einen männlichen oder weiblichen Protagonisten spielt:
Die verschiedenen Partner kann man als Belohnung innerhalb von Aufträgen aber auch in einigen Missionen bekommen. Ähnlich wie in dem Lagerungssystem der Editionen, werden die Partner-Pokémon, welche den Protagonisten gerade nicht begleiten auf der Partner-Farm aufbewahrt.
In R3 wird der Spieler von dem Ukulelen-Pichu begleitet. Dieses besitzt eine besondere Fähigkeit, "Pichus Ukulele" mit der es das zu fangende Pokémon beruhigt. Allerdings ist es nicht wie die anderen Pokémon-Freunde in der Pokémon-Freund-Leiste, sondern taucht manchmal plötzlich am unteren Bildschirmrand auf. Danach springt es in die Mitte des Spielfelds und spielt auf seiner Ukulele. Im Laufe des Spiels wird die Ukulele immer wieder gestimmt, wodurch die Poké-Stärke immer wirkungsvoller wird.
Reitet man auf Latios oder Latias, so nimmt dieses die Rolle als Partner-Pokémon ein. Es taucht wie das Ukulelen-Pichu am unteren Bildschirmrand auf und erzeugt einen Strudel, der alle Pokémon an einem Punkt zieht, was ideal ist, um sie zu fangen, da sie nun nicht entkommen können und noch dazu alle auf einem Punkt versammelt sind.
In der Vergangenheit kann man sich einen Partner aussuchen, wenn man die Herztafel von diesem Pokémon besitzt.
