Nach der Begegnung mit Schwerthold und Schildrich im Schlummerwald treffen sich der Protagonist und Professor Sania im Labor. In diesem befindet sich auch Sanias neue Assistentin. Da der Energiequellen-Detektor beim Auftreten der zwei Königssöhne reagiert hatte, vermutet Sania, die zwei „Clowns“ Schwerthold und Schildrich mit diesem aufspüren zu können. Der Detektor zeigt einen ungewöhnlich hohen Ausschlag im Turffield-Stadion. Sie bittet den Protagonisten, dies genauer zu untersuchen.
Während sich der Protagonist um die DynamaximiertenPokémon im Keelton-Stadion und Engine-Stadion kümmert, erscheinen Schwerthold und Schildrich im Labor. Auch Professor Magnolica findet sich dort ein. Obwohl es ihr Labor ist, befindet sich Professor Magnolica während der Hauptstory und der Afterstory nur dieses eine Mal im Pokémon-Labor. Sie verlangen von Sania die Herausgabe der Wunschsterne, die sie nach der „Finstren Nacht“ aufgesammelt hat. Sania kontaktiert über ihr Smart-Rotom den Protagonisten, welcher sich zugleich mit Hop und Nezz auf den Weg zum Labor macht. Im Labor eingetroffen, fordern die Brüder Hop und den Protagonisten zu einem Multikampf heraus. Das Pokémon-Team gleicht den Teams, die sie auch im Schlummerwald besitzen, bis auf Lauchzelot, auf welche beide verzichten. Nach dem Kampf stellt sich heraus, dass dieser rein als Ablenkungsmanöver diente, damit die Assistentin die Wunschsterne entwenden und den Brüdern überreichen konnte. Sobald der Protagonist das Labor verlässt, schlägt der Energiewellen-Detektor erneut aus und meldet Ausbrüche im Passbeck-Stadion, im Fairballey-Stadion, im Circhester-Stadion und im Claw-Stadion.
Nach den Ereignissen mit den Königssöhnen befinden sich Professor Sania und ihr neuer Assistent Hop, der nun Professor werden möchte, im Pokémon-Labor.
In Schwert und Schild: Die Legenden erwachen! sieht man, dass die Professorin und ihre Enkelin über die Ergebnisse der Finstren Nacht diskutieren, bevor bekannt wird, dass Sania nun selbst zur Professorin ernannt worden ist.