Wie in Pokémon Ranger gibt es auch in Pokémon Ranger: Finsternis über Almia zusätzliche Event-Missionen, die nachträglich freigeschaltet werden können.
Beim ersten Teil der Pokémon-Ranger-Reihe gab es Zusatzmissionen zu Vorlage:Id, dem Vorlage:Id-Ei, Vorlage:Id und Vorlage:Id. Während diese Missionen in der US- und europäischen Version standardmäßig integriert waren, musste man sie in Japan hingegen auf verschiedenen Events herunterladen. Die Missionen mit Deoxys und dem Manaphy-Ei gab es beispielsweise nur im Rahmen der „W-Mission“-Verteilung. Nur wer ein Vorbesteller-Kinoticket des 9. Pokémon-Film vorweisen konnte, durfte diese Missionen herunterladen.
In Pokémon Ranger: Finsternis über Almia gibt es insgesamt 6 zusätzliche Event-Missionen, die (zumindest in Japan) alle über die Nintendo Wi-Fi Connection verteilt wurden. Wer keinen Zugang zur Nintendo Wi-Fi Connection hat, konnte sich diese Missionen auch in zahlreichen japanischen Läden über eine Drahtlosverbindung herunterladen.
In dieser Mission findet ein Vorlage:Id das Manaphy-Ei. Der Spieler muss das Manaphy-Ei nun beschützen. Wenn er das geschafft hat, kann er es, wie beim Vorgänger auch, auf die Diamant-/Perl-/Platin-/ HeartGold-/Soulsilver Edition übertragen.
Hier muss ein Riolu gerettet werden. Ist der Spieler erfolgreich, so kann er dieses Vorlage:Id, welches dann sogar eine Attacke beherrscht, die es normalerweise nicht erlernen kann, ebenfalls auf seine Diamant- und Perl-Edition übertragen.