Als Boss werden die Anführer einer Verbrecherorganisation bezeichnet. Sie leiten das jeweilige Team und wollen ihren diabolischen Plan in die Tat umsetzen. Hier sind sie samt Team aufgelistet:
- Team Rocket
- Giovanni
- Madame Boss (ehemalig)
- Mann mit der Maske † (Manga)
- Carr (Manga)
- Team Magma
- Marc
- Team Aqua
- Adrian
- Team Galaktik
- Zyrus
- Team Plasma
- N
- G-Cis
- Team Krall
- Drakrall
- Team Crypto
- Intrigo (COL)
- Phrenos (XD)
- Power-Rock-Bande
- Gunter
- Team Nachtschatten
- Nubilus Strahlemann
- Pokénapper
- Teegesellschaft
